Микробиом може да предскаже мутационен статус на рак на дебелото черво

2023 Автор: Agatha Gilson | [email protected]. Последно модифициран: 2023-11-26 16:56

БАЛТИМОР - Анализът на микробиома, обкръжаващ тумори на рак на дебелото черво, може да се използва като неинвазивен скринингов тест, който е по-чувствителен и специфичен от фекалните тестове за окултна кръв, сочат резултатите от ново проучване.

"Това е нещо, което може да бъде критично за рака на дебелото черво, тъй като всеки тумор може да има различен мутационен пейзаж с различни мутации на гени и това може да има ефект върху микробиома", казва Ран Блехман, д-р от Университета на Минесота в Минеаполис, Резултатите от изследването бяха представени тук в Американското дружество на човешката генетика 2015.

Д-р Блехман и неговите колеги разгледаха генетичните разлики между здрави клетки на дебелото черво и туморни клетки от възрастни с колоректален рак и откриха, че специфичните мутационни тумори са свързани с наличието на специфични бактерии в червата.

Например при хора с мутация на ген на APC има силна връзка между фамилна аденоматозна полипоза, синдром на наследствен рак и изобилие от Fusobacterium, каза д-р Blekhman.

Той посочи, че неговата лаборатория е първата, която анализира връзката между специфичните туморни мутации и състава на туморния микробиом.

Повече мутации, повече разнообразие

Изследователите използвали цялостно екзоматично секвениране, за да оценят протеино-кодиращите участъци на тумори и микробиомно профилиране, за да характеризират микробиотата в туморните биопсични образци и нормалните проби на дебелото черво от 44 възрастни с рак на дебелото черво.

Те откриха, че колкото повече мутации, толкова по-разнообразни са бактериалните видове в микробиома на тумора.

И за определени гени имаше връзка между соматичните мутации и промените в изобилието от специфични микроби.

Други доказателства за връзката между бактериите и тумора бяха наблюдавани на нивото на пътя.

Мутациите на загуба на функция бяха открити в пътищата за транспортиране на туморна глюкоза и бяха силно свързани с по-високи нива на използване на енергия в микробиома, каза д-р Блехман. Това предполага, че туморът и бактериите в неговия квартал се конкурират за телесни ресурси.

Изследователите създадоха индекс на риска, който оцени връзката между микробите и всяка от няколко известни мутации на драйвера на тумора. Индексът бе в състояние точно да предвиди наличието на мутация на загуба на функция в ZFN717, ген, кодиращ нуклеаза на цинков пръст, част от семейство ензими, участващи в възстановяването на ДНК.

Тези открития предполагат, че е възможно генетично класифициране на тумори само от фекални проби. Теоретично това означава, че манипулирането на туморната микросреда може да се използва за предотвратяване или лечение на рак на дебелото черво, обясни д-р Блехман.

Това проучване отчасти се занимава с проблема с „скритата наследственост“, казва Крис Гюнтер, доктор на медицинските науки от университета в Емори в Атланта.

"Ако погледнете сега проучванията за последователност на рака, те идентифицират нещо като 10 възможни мутации на водача. Все още не сме успели да предвидим какви ще са всички шофьори и пътници", каза тя пред Medscape Medical News.

"Ако този вид работа може да ни помогне да стесним списъка, това би трябвало да допринесе за разбирането ни как се развива ракът", каза тя.

Д-р Blekhman и д-р Gunter не разкриха финансови взаимоотношения.

Американско общество на човешката генетика (ASHG) 2015: Резюме 240. Представено на 9 октомври 2015 г.