Бют за преследването на Крайния изходен кодекс на човечеството

2023 Автор: Agatha Gilson | [email protected]. Последно модифициран: 2023-08-25 04:57

Търся крайния изходен код

Ерик Дж. Топол, д-р: Здравейте. Аз съм Ерик Топол, главен редактор на Medscape, и имам много вълнуваща сесия един на един с Атул Бют, който се е преместил от университета в Станфорд в Калифорнийския университет, Сан Франциско (UCSF). Той ще ръководи Института по изчислителни здравни науки. Атул, прекрасно е да имаш възможност да го посетиш.

Атул Буте, доктор на медицинските науки: Страхотно е да сме тук на срещата на бъдещата геномна медицина.

Д-р Топол: Вие сте ветеран, като сте били тук преди, но работата ви е доста необикновена. Нека да поговорим за твоя произход като педиатричен ендокринолог, а също и като изчислител. Как попаднахте в двете полета?

Д-р Бът: Още в гимназията знаех, че харесвам компютърните науки и медицината. Мислех, че ще порасна, за да бъда рентгенолог. По онова време на корицата на National Geographic имаше тази технология, наречена „ЯМР“и „КТ сканиране“, и тогава, докато бях в медицинско училище, проектът за генома стартира. Разбрах, че това, което исках да направя, е да разбера най-добрия изходен код на човечеството. Това беше в началото на 90-те години.

Обучих се като педиатър, защото за мен педиатрията е най-близка до генетиката. Педиатричните пациенти не правят много за себе си; всичко е генетика. После завърших да тренирам още малко и съм в Станфорд от 10 години. Сега се премествам към UCSF.

Ролята на Академията в промяната на света

Д-р Топол: Разкажете ни за 10-те години, които сте прекарали в Станфорд. Какво успяхте да постигнете през това десетилетие?

Д-р Бът: Аз започнах този първи ден с награда за кариерно развитие - една от онези K награди, които всички ние търсим като младши преподавател. Приключвам с екип от 30 души. Публикувахме 200 доклади и получихме 15 или 16 безвъзмездни помощи за Национални здравни институти. Не казвам това, за да се хваля, а за да кажа на младшия факултет на бъдещето, че е възможно да се направи това. Възможно е да промените света, като се придържате към академичните среди. Все още съм огромен фен на академичните среди; затова оставам академик, когато премина към UCSF. Днес е по-труден климат, но мисля, че все още става въпрос за промяна на света. NIH признава това. Възможно е да го направите.

Д-р Топол: Когато се замисля за големи данни и лекарства, ти идваш на ум, но вероятно през цялото време си мислил голям. Имахте голяма визия за това къде можете да вземете това, нали?

Д-р Бът: Днес терминът е "големи данни". Независимо дали го наричате „прецизна медицина“или „изчислително здраве“, те означават едно и също нещо - медицина от първа линия. Медицината става все по-компютъризирана в смисъл на данни.

Има два големи шофьора. На тази среща говорим за генома и проекта за генома. Там се измерват много байтове, но в медицината също записваме повече от нещата, които правим или измерваме от пациенти в електронни здравни записи. Сблъсъкът или синергията между тези двама е вълнуващо място.

Д-р Топол: Когато започнете в новия институт, ще бъде ли трудно да оставите всички след себе си в Станфорд или ще вземете някои от тях със себе си в UCSF?

Д-р Бът: Надявам се да взема целия си екип, плюс или минус няколко, които трябва да останат по причини за пътуване. Надявам се да взема всички тях.

За да е ясно, не бях недоволен от Станфорд. Бях развълнуван. Просто UCSF има много висши ръководства, които разбират тази фраза „прецизна медицина“. Те участват в плановете на Института по медицина за прецизна медицина. Дори преди 4 години Кийт Ямамото и Сю Дезмънд-Хелман, които сега напуснаха да бъдат част от фондацията на Гейтс, бяха част от този набор. Това набиране продължава вече 4 години. Виждам, че нова сграда се създава около изчислителното здраве и много бъдещ потенциал.

Дом за големите данни

Д-р Топол: Накъде върви тази област, в UCSF и в много по-голям мащаб? Ще генерираме терабайт данни на индивид. Ще имаме сензори за кръвно налягане и за всеки сърдечен пулс. Няма дом за тези данни. Как ще разрешим всички тези проблеми?

Д-р Бът: Бъдещето ще бъде сложно, преди да стане по-просто. Ще имаме милиони парчета данни за милиони хора. Тази сутрин на срещата чухме Франсис Колинс да говори за кохорти на доброволци в Америка. UCSF ще бъде част от това. Имаме 12-13 милиона пациенти в Калифорнийския университет (не само в UCSF, но в целия Калифорнийски университет), които биха искали да бъдат част от това усилие. Това е част от причината да се движа. Хората са в състояние да направят повече измервания върху себе си, независимо дали това е техният модел на сън или сърдечната честота.

Не мисля, че данните ще живеят на едно място, но на различни места. Различни места ще искат да стигнат до тези данни. Пациентите и хората ще имат по-голям контрол върху своите данни (например как да споделят своите данни) и лекарството трябва да се движи по-бързо и данните ще бъдат решението.

Д-р Топол: Вие напускате частен университет - Станфорд - който е известен още като Стартиращ университет.

Д-р Бът: Точно така.

Предприемачество: не за забогатяване

Д-р Топол: Това е доста почва за предприемачество. Започнали сте няколко компании. Сега отиваш в държавен университет. Имате ли някакви неприятности по този въпрос?

Д-р Бът: Нямам никакви проблеми. Всъщност по отношение на предприемачеството, UCSF е там горе. Малко по-институционализирана е. Рег Кели работи над нещо, наречено "QB3" вече повече от 10 години - усилие между UCSF, Калифорнийския университет в Санта Крус и Беркли. Сградата до мястото, където ще бъда, има място за инкубатор за тези компании в UCSF. Редица други компании, като Johnson & Johnson и други, вече са изградили сгради около Mission Bay, за да инкубират някои от тези биотехнологични и технологични компании.

Не гледам на по-малко предприемачество; Гледам повече предприемачество там. Продължавам да споменавам предприемачеството не защото се опитвам да забогатя, а защото моята лаборатория вярва, че ако искаме да променим света, не можем просто да продължим да пишем документи за това. Ето как ще го получим на пациентите.

Д-р Топол: Това е доста важно послание за излизане. Създадохте една от тези компании със съпругата си, така ли е? Можете ли да ни кажете за това?

Д-р Бът: Компанията се казва NuMedii. Съпругата ми и аз, а сега и други, сме част от компания по препозициониране на наркотици - намиране на нови употреби за наркотици. Всички знаем класическите истории за сърдечните лекарства с интересни странични ефекти, които се превръщат в такива лекарства като Виагра® и миноксидил за плешивост. Вместо да намерите тези нови употреби случайно, какво ще кажете за намирането им нарочно? Какво ще кажете да ги намерите с публични големи данни, вид огромни усилия, които НИХ финансира в лаборатории? Тези данни трябва да бъдат споделени в интернет, така че разбрахме, че можем да използваме отново данни за лекарства и данни за болести, да съберем тези две и да намерим тези нови приложения за лекарствата. Да се извади търговски смисъл от това е по-трудно.

Д-р Топол: Вече публикувахте някои от своите открития.

Д-р Бът: Ние публикувахме двойка; най-новата ни публикация от миналата година беше на антидепресант, който сякаш разтапя дребноклетъчен рак на белия дроб. Това е пример за това как преминахме от реалните изчислителни данни до стартирането на клинично изпитване за около 15 месеца. Пробният процес струваше около 50 000 долара, а не 50 милиона долара. Това със сигурност не е милиард долара. По някакъв начин бъдещето ще предлага повече употреби за повече лекарства и ще ги подлага на изпитания на пациенти по много по-бързи и по-евтини начини.

Съвети за млади следователи

Д-р Топол: Това е доста поразително. Все още си доста млад следовател.

Освен това, което вече споменахте, имате ли някакво друго съобщение, което да предадете на по-младите хора в Medscape за това как да продължите с кариерата си?

Д-р Бът: Едно нещо, за което научих, че съм в Силиконовата долина през последните 10 години, е, че вече не е редно да бъдем предпазливи при създаването на академична лаборатория. По някакъв начин стартирането на съвсем нова академична лаборатория е като получаване на финансиране за стартираща компания. Ако няма да промените света след 3 години, нито ще убедите инвеститорите на Sand Hill Road или тези в учебния раздел в Бетесда, Мериленд. В тези роли има много синергия.

Днешната роля на иноватор е да убеди стая, пълна с хора, да ви даде пари за изпълнение на вашите идеи. Когато получите тези пари, трябва да промените света за 3 години.

Изследователят на бъдещето ще мисли за много важни проекти. Снимайте за промяна на света. Оставете консерватизма след себе си. Това би бил моят съвет.

Д-р Топол: Това са доста силни неща. Чух това сравнение между Силиконовата долина и NIH и как да се хареса и на двете.

Д-р Бът: Съпругата ми ме научи на това преди около 10 години.

Д-р Топол: Много ви благодаря, че се присъединихте към нас в Medscape Един на един. Със сигурност сте един от най-интересните хора в света на медицината и ви пожелавам най-добри успехи в новата ви програма в UCSF.

Д-р Бът: Много ви благодаря. Благодаря, че ме приехте тук.